空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni）是弯曲菌属的一种，选择性体外分离培养结果表明，人类弯曲菌的感染90%是由空肠弯曲菌和结肠弯曲菌引起的，这两类中有90%以上是空肠弯曲菌引起的。

目前已发现弯曲菌属有21种菌种和多种亚种，除空肠弯曲菌、结肠弯曲菌外，其他菌种，如红嘴鸭弯曲菌(C.lari）、胎儿弯曲菌(C.fetus)和上凸弯曲菌（C.upsaliensis)，也可以引起人类感染。空肠弯曲菌种可分为两亚种:空肠(jejuni)亚种和德莱(doylei)亚种，其中空肠亚种是主要的人类肠道病原菌。

空肠弯曲菌染色体的大小为1.6~1.8Mb，总的G+C含量较少，为29%~38%。无论是形态特征还是遗传特征，空肠弯曲菌都有较高的多样性。2000年，Sanger公司首次完成对空肠弯曲菌空肠亚种菌株NCTC11168的基因组测序，目前GenBank已经有5株空肠弯曲菌全基因组序列的报道，分别为空肠弯曲菌空肠亚种NCTC11168、空肠亚种81-176、空肠亚种81-116、空肠亚种RM1221和德莱亚种269.97。全基因序列的完成使空肠弯曲菌遗传特征研究获得飞跃，目前以基因芯片为基础的基因组比较分析成为空肠弯曲菌遗传分析的主要工具之一。Dorrell等通过比较基因组的研究发现，79%(1300/1654)的基因在空肠弯曲菌是保守的，它们是管家基因，编码一些功能蛋白，如氨基酸的合成、细胞的代谢调节等; 21% (354/1654)的基因可塑性很高，主要编码细菌的膜结构，如鞭毛、脂多糖(LPS)以及英膜等，部分可变基因与糖的转运以及代谢有关，并且相同来源以及聚类相似菌株的变异特点相近。

细菌的质粒是细菌除染色体外的另一种遗传物质，研究发现32%的空肠弯曲菌含有2~162kb大小的质粒。与空肠弯曲菌毒力相关的两种质粒有pTet和pVir。pTet质粒属于R质粒，携带四环素耐药基因tet(O)。 pVir质粒又称侵袭质粒，含有编码幽门螺杆菌四型分泌系统的基因，研究发现含有pVir质粒的菌株对宿主细胞的黏附力和侵袭力比不含pVir质粒的菌株有所增强。