细菌培养：各国指南以鼻咽部分泌物的培养作为诊断百日咳的“金标准”，理想状况是2周内采集标本。

核酸检测：以PCR/Real-timePCR为代表，发病3周内采集。

血清学检测： 往往应用疾病后期诊断，通常在感染百日咳鲍特菌4周后。受到疫苗接种影响，应慎重解读抗PT-IgG抗体检测结果。

血常规检测：临床血常规检测对于诊断百日咳具有重要意义， 0～3月龄婴儿在疾病早期（＜3 周）可检测血常规。

抗生素敏感性检测：表型检测大多采用E-test和Kirby-Bauer纸片扩散法，未能广泛应用。

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