1.纯培养法

纯培养法是最常用的分离菌种的方法之一。它的原理是将一个混合菌群分离出其中的单个菌株，并将其在无菌培养基上进行单一菌株的培养。纯培养法包括两种方法:稀释法和划线法。

2.筛选法

筛选法是通过某种选择的方法，将特定的菌株筛选出来。这种方法通常适用于筛选对特定抗生素敏感的菌株。

3.酵母菌分离法

酵母菌是一类单细胞真菌，对于它们的分离和培养，需要使用一些专门的技术。常用的酵母菌分离方法包括点状法和快速分离法。

4.培养基选择法

熟练使用各种基础培养基并能根据需要自行调制适宜的培养基，将极大促进菌种分离的成功率。不同类型的细菌需要不同类型的营养物质，因此，适当选择合适的培养基可以增加分离菌株的积极性，从而提高培养成功率。