军团菌病肺炎是一种以肺炎为主的多系统疾病，属于重型，侵袭率5%，可引起死亡。潜伏期为 2~10d，初期低烧、头痛等，持续1~2d后表现为高烧(39~41℃)、干咳(或咳痰)、呼吸困难、气短、畏寒、胸痛等。X射线检査有肺炎的症状，米克戴德军团菌感染所致肺炎易形成肺脓肿。重症患者常可导致呼吸衰竭，10%的重症肺炎并发急性呼吸窘迫综合征，其他并发症还有急性肾功能衰竭、休克和弥散性血管内凝血。由于有明显的肺外症状，有时其掩盖呼吸系统症状。该病病程长，需要7~14d痊愈。

本病病程早期即可发生肺外多系统受累的表现。伴发于肺炎的肺外感染可累及脑、肠肾、肝、脾、腹膜、前列腺、心包膜、骨髓、皮肤及筋膜、直肠、心肌、外周淋巴结、甲状腺、胰腺、睾丸和肌肉等，无肺炎时也可发生的肺外感染部位包括血液、伤口、肠、鼻窦心内膜、腹膜、心包膜、皮肤及筋膜等。

有时这些肺外感染不是在肺炎进展期，而是在肺炎获得有效抗生素治疗数周后才明显地表现出来。偶尔，肺外感染的症状和体征也可出现在肺炎之前，尤其是嗜肺军团菌感染所致的腹膜炎，往往无法确定其是继发于肺炎，抑或原发性肺外感染。肺外多系统受损可呈多种多样表现，也可出现两个或两个以上系统同时受损，因此有发热伴多系统受损者应警惕本病。