1、引物设计:获得弯曲菌的16srRNA基因,空肠弯曲菌mapA基因,结肠弯曲菌ask基因和胎儿弯曲菌cstA基因的特异性序列,基于软件Primer5.0工具设计引物。
2、细菌基因组DNA的提取
制备空肠弯曲菌、结肠弯曲菌、胎儿弯曲菌的 DNA 模板。在准备的 CCDA 平板上接种,42℃ 微需氧环境下培养二天后选择5个菌落,加入到 0.1mL灭菌去离子三蒸水(SW)中且充分吹打均匀,沸水煮10min,取出后放置在冰上,8000r/min高速离心5min,将上清液转移到-20℃条件下保存,取菌株 DNA 进行特异性及灵敏度检测。
3、多重PCR扩增条件优化
PCR体系(20μL)中各成分的量如下:2xTaqMastermix10μL,引物各1μL,DNA模板溶液2μL,按要求加入后离心15s,收集反应物后进行扩增。
对体系最适退火温度进行摸索,PCR反应程序设置为:95℃15min,95℃30s,50-60℃(8个梯度进行梯度PCR)90s,72℃1min,30个循环,72℃10min,4℃低温条件下保存。
电泳鉴定:根据分子量大小配制1.0%琼脂糖溶液,然后取出其中8μL扩增所得产物点样,以 DNAMarkerDL2000 作对照,100V 恒压电泳 40min后取出凝胶,通过凝胶成像软件观察结果。
4、多重 PCR 特异性检测
使用建立的PCR体系对空肠弯曲菌、结肠弯曲菌、胎儿弯曲菌以及大肠杆菌、沙门氏菌等 11株参考菌株进行检测分析,凝胶电泳后 UV成像观察并对扩增情况进行分析。
5、多重 PCR 灵敏度检测
通过分光光度计测定空肠弯曲菌、结肠弯曲菌和胎儿弯曲菌的 DNA 抽提液,且据此测定 DNA 含量,进行 10倍梯度稀释处理,获得系列梯度稀释液,各取2μL 分别进行扩增,对条带亮度进行观察,直到不出现扩增条带为止。