酶底物法水质检测相较于滤膜法具有以下优势：

1. 检测速度快
   酶底物法通常能在24小时内完成检测，而滤膜法需要48小时或更长时间。

2. 操作简便
   酶底物法步骤较少，无需复杂设备，滤膜法则需要过滤、培养等多个步骤，操作较为繁琐。

3. 灵敏度高
   酶底物法能检测到更低浓度的微生物，尤其适用于低污染水样。

4. 抗干扰能力强
   酶底物法受水样中杂质影响较小，滤膜法容易因杂质堵塞滤膜而影响结果。

5. 结果直观
   酶底物法通过颜色变化判断结果，易于观察，滤膜法则需人工计数，存在主观误差。

6. 自动化程度高
   酶底物法可与自动化设备结合，减少人为误差，滤膜法自动化程度较低。

7. 适用范围广
   酶底物法可用于多种水质检测，滤膜法在某些特殊水样中效果不佳。

8. 成本较低
   酶底物法耗材和人力成本较低，滤膜法需要更多耗材和人力。

9. 便携性
   酶底物法设备便于携带，适合现场检测，滤膜法则需要实验室环境。

10. 数据记录方便
    酶底物法结果易于数字化记录，滤膜法依赖人工记录，容易出错。

综上，酶底物法在速度、操作、灵敏度、抗干扰、成本等方面具有明显优势，尤其适合快速检测和大规模筛查。